En la página del enlace provisto se enseña cómo hacerlo, básicamente debes poner las carpetas con sus parches en el directorio wow, solo mantén los directorios de carpetas como si fuera un ejemplo normal de mpq: Character \ BloodElf \ Female \ BloodElfFemale.m2 (esta estructura debe mantenerse), el secreto es tener un wow.exe modificado para aceptar esto.